学校前身为长江工程大学，是在毛主席、周总理直接关心下，为满足长江开发治理需要，于1959年成立的本科高校，首任校长是被毛主席称为“长江王”的林一山。1974年11月从武汉市外迁到赤壁市恢复办学，更名长江水利水电学校，是国家级重点中专。1982年3月成立长江职工大学，与长江水利水电学校实行“两块牌子、一套班子、两个层次、统一管理”的组织体制。2003年升格为长江工程职业技术学院。2004年由水利部划转湖北省人民政府管理。2008年整体回迁武汉办学。2009年丹江口职工大学进入，2021年湖北省工业经济学校进入，形成了文化大道主校区、长江新区校区“一校两区”办学格局。其中，文化大道校区位于武汉市江夏区文化大道9号，长江新区校区位于武汉市黄陂区武湖镇汉施大道82号，占地总面积600余亩。