学校坚持围绕产业链调整专业链、围绕专业链建设课程链、围绕课程链培育人才链，对接产业地图，优化专业布局，目前设有智能制造学院、电子信息学院、工业互联网学院、建筑与环境艺术学院、交通与物流学院、经贸与管理学院、教育学院、医卫学院8个二级学院，开设了46个专业及方向，其中中央财政重点支持专业2个，国家示范重点建设专业4个，国家装备制造业示范专业点1个，国家1+X试点专业1个，国家级骨干专业2个，省级高水平专业群2个，国家级实训基地3个，湖北省品牌专业1个，湖北省特色专业5个，3+2专本衔接专业1个，现有中高职在校生1.5万余人。2022年1月，省教育厅“双高”建设名单公示，湖北工程职业学院被立项建设省级高水平高职学校，物联网应用技术专业和机械制造及自动化专业被立项为省级高水平专业群。