贵州黔南科技学院转设前是贵州大学科技学院，学校于2001年5月经贵州省人民政府批准成立，2004年1月获国家教育部首批确认，是一所综合性的全日制本科独立学院。2014年12月，贵州大学与贵州捷星慧旅航空空乘咨询服务有限公司签订合作举办科技学院协议。办学校址历经三次搬迁，2018年3月整体搬迁至贵州省黔南州惠水县，规划占地面积1191.4亩。

学校先后被评为贵州省直属高校党建工作示范点，贵州省“五好”基层党组织、省直属高校“五好”基层党组织、贵州省“五四红旗团委”，“全国‘三八’红旗集体”、“全国‘十一五’教学科研先进集体”等称号。